这些古建筑除一部分是专门作祭祖联宗用外，其他都是祠居合一的复合型建筑，普遍采用客家地区“九厅十八井”结构布局建造，门庐威严，庭院舒畅，雕梁画栋，飞檐翘角，雄伟壮观，气势恢宏，美轮美奂。这些建筑设计科学，实用性极强。宗祠门窗众多、空气对流较好。加上合理的天井，通风采光良好，热天不觉闷热，雨天不潮湿。与此同时，古宗祠在设计上还兼顾了防火与实用。宗祠内有月池、水井，围墙外水沟环绕，常年有从村外引来的溪水流过。这些设置既利洗涤排污，又利蓄水救火。月池还可种植荷花以供观赏。芷溪古宗祠祖屋内文化内涵极为丰富。不仅有黄庭坚、何绍基、邱振芳、孟超然、伊秉绶、廖怀清、林则徐等名贤墨宝，而且有众多朝廷所赐的功德牌匾。这些古建筑中，比较有代表性的有庚福公祠（黄氏家庙）、龟山公祠（杨氏家庙）、杨辉公祠、峻亭公祠、澄川公祠、翠畴公祠、孝友祠、孔怀堂公祠、华岳公祠、隐轩公祠、耀南公祠、集鳣堂（渔溪公屋）、培兰堂（笃兴店）、余庆堂（三大门闾）、永裕堂、万斯堂、怡庆堂、观察第（怀永堂）、乔荫堂（福昌店）、慎修堂和十余座大夫第等。
黄氏家庙
连城县文物保护单位——黄氏家庙，又称庚福公祠、大祠堂，位于芷溪茶山口往寨上路口，是黄氏裔孙为纪念开基祖庚福公而建。黄氏家庙始建于清顺治十三年（1656年），至康熙三十一年（1692年）完工，历时36年。现在这座祠堂为嘉庆元年（1796年）建造，并于公元2006年重新修缮木牌楼，现为芷溪离退休协会和芷溪申报国家级历史文化名村筹备处。
祠堂坐东向西，建有上下两厅、回廊、大屋间、天井、石狮、石鼓，周边建围墙、月池、草坪、雨坪和厨房，总占地面积为3021.5平方米。门楼牌匾“黄氏家庙”是现代书法家罗钟所书，对联“孝友无双绵世德，文章第一振家声。”和上厅楹联，“世泽浚源长，孝友无双，千秋俎豆昭前烈；家声遗韵远，文章第一，百代衣冠推先贤。”相传是宋代黄庭坚所撰，为乾隆吏部尚书兼太子太师黄锦所书。雕梁画栋和大部分文化皆因文革被损毁，现存“文魁”匾额4块，“州司马”3块，“父子乡宾”、“明经”、“亚魁”、“选魁”各1块。此祠堂有一个至今未解之谜：自建造以来祠堂内从无蜘蛛结网，周围虽有水草，夏天也无蚊蚋，乡人堪称芷溪一奇。
杨辉公祠
连城县文物保护单位——杨辉公祠，亦称杨氏家庙、恒德堂，位于芷溪杨背街，坐东向西，建筑与黄氏家庙相似，有上下厅、大屋间、回廊、天井等等，不过规模较小，且毁坏情况更为严重，现辟为芷溪文化中心民间乐队活动室。
杨辉公祠现存杨斌、仰亭兄弟的“兄弟登科”匾、杨焕藜的“孝廉方正”匾和杨燕山的“州司马”匾等。“门前屠宰场，祠内无腥臭”为芷溪三奇之一。
蹑云山房，位于沙圳巷东口，是芷溪清代四大书院之一，山房内设居所、厅堂，院中有月池、假山，旁边为一座两层小木楼，山水壁画，诗书意浓，为读书佳处。
宝善堂，位于沙圳巷西口，为“双门楼”，前门楼写“大夫第”，后门楼写“文明气象”，“双龙戏珠”镂空石雕工艺精湛。1982年长春电影制片厂拍摄的电影《忘忧草》的主要取景地。
观察第，又称怀永堂，位于沙圳巷西路口对面，现存16块执事牌。
澄川公祠
连城县文物保护单位——澄川公祠，又称孔硕堂，位于沙圳巷西北角，为芷溪黄姓开基组庚福公第十四世裔孙澄川公于清朝同治年间建造。祠堂坐东向西，建有雨坪、围墙、石牌楼、正厅、下厅、天井、回廊、大屋间和厢房间，因有一圳溪水从祠前流过而没建月池，建筑面积大约400平方米。
该祠建的石牌楼为芷溪现存两座之一，石牌楼高近6米，柱直径达1.2米，顶部刻有人物、鸟兽、花卉和双龙戏珠等图案，刻工精美，全部用上等花岗岩砌成，构造天衣无缝，布局设计独具匠心，雄伟壮观，气势恢宏，数闽西少有。
大夫第群，位于大石头边，为集中的古民居群，正面为两座“大夫第”和“福安堂”。两座“大夫第”又称吉昌堂、孚吉堂，南边的是孚吉堂，为黄鸣谦故居，其与周恩来、邓小平、聂荣臻、李富春等人留学法国；福安堂则是原任国民党国大代表、金门县县长黄际蛟的故居。
有竹人家，位于下神树山，是坐落在大夫第群后的小巧民居，其名有些幽默意味。
万顺堂，位于下神树山，门楼题字“挹爽西山”，飞檐斗角，五彩绚烂，两侧小篆为民国书法家黄肇河所书。
培兰堂，也称笃兴店，位于芷溪下神树山，为芷溪小规模民居中的精品。门楼色彩斑斓，砖雕精美，庭院风格独特，木雕工艺令人叫绝。
杨氏家庙
连城县文物保护单位——杨氏家庙，也称龟山公祠，坐落在杨成武上将祖籍地芷溪背园，奉祀福建理学鼻祖杨时（号龟山），于康熙六年（1667年）由六九郎公的第八、九代（含迁徙至广东、江西和本省其他县的）裔孙合族兴建。
相传建该祠时有不良分子阻挠，外迁闽粤赣三省的宗亲均有派人回来，其中官员就有知府2人、知县29人，当地父母官见状遂予以平息。杨氏家庙占地仅600平方米，木牌楼是芷溪现存最古老的，神龛非常具有代表性，内有名联“支同一脉联三省，享配千秋序十伦”。
仁美堂，位于红天灯巷，建于明代，门框为紫红色沙砾条石，对联阴刻，深青的砖雕异常精美，花窗、屏风古朴，神龛精致。
隐轩公祠，位于红天灯巷旁，牌楼式门楼，门楹、门框、门槛均采用汉白玉建造，门面主体为青砖，衬缀红花格窗，配以两侧的青釉瓷花窗，门前雨坪开阔，更显大气大雅。
凝禧堂，位于红天灯巷南侧，有独特的一前一后、一左一右两座门楼，屋内构建宽大，雕梁画栋，上厅匾额黑底金字书题“凝禧堂”三字，铁画银钩而成剑拔弩张之势，堪称书法神品。
乔荫堂，位于四叉路口南侧，又叫福昌店，为林彪旧居。建筑小巧精致，保存完好，二进厅，屏风吊篮和花窗木雕精致。1929年红四军第一纵队司令林彪曾在此居住，但所留笔迹因刷洗多次而真迹难辨。
慎修堂，位于四叉路口西侧，为黄海故居。侧门门楹刻“大夫第”，正门则在侧门右侧后，让出一深雨坪，庭院雅致，花窗、吊篮精美。民国3年，黄海与傅柏翠等人东渡日本留学并追随孙中山，取得政法学士学位回国后，在北伐革命军中任团长，革命失败后，黄海在郁郁中英年早逝。
翠畴公祠，又称明馨堂，位于赤树乾，为芷溪黄姓开基组庚福公第三房十七世裔孙翠畴公祠堂，始建于光绪十八年（1892年），前后历时8年，于光绪二十五年（1899）竣工。该宗祠有类客家“围屋”的风格，大门朝南，东、北各有一小门，正厅两侧为对称厢房，建有石狮、镂花石鼓、雨坪、月池、学堂、花园，建筑面积700余平方米，总占地面积约900平方米。此外，整座祠堂共有天井七口，方塘两口，月池一口，暗合“七星拱月”“二泉映月”之寓意。
该祠建成时，装饰之华丽、工艺之精致，在整个闽西客家地区民居建筑中都是极为罕见的。门楼琉璃瓦顶，金箔鳄鱼翘角，金边金字蓝底堂名，显得金碧辉煌，巍峨壮观。前厅上下四根顶梁大柱饰以大红油漆；下厅及中门屏风，有精美的梅兰菊竹、福禄寿喜、文房四宝、蝙蝠等镂空雕刻；所有梁柱分别雕刻有“二十四孝”、“郭子义拜寿”、“苏武牧羊”等传说故事图案；厅内有“三打祝家庄”、“水淹金山寺”等线条精细、色彩绚丽的壁画；门楼厅两端墙上为“麻姑献寿”和“东方朔偷桃”两幅壁画。现存五块执事牌，木制门楼独具一格。
和乐居，位于赤树乾，建于清代，为黄中越故居，砖木结构，规模较小，门楼门楹题刻“光依日月”。黄宗元，黄埔军校第五期毕业，曾任国民党运输兵团少将。
集鳣堂
连城县文物保护单位——集鳣堂，又称渔溪公屋，建于康熙末年（1722年），迄今已有280多年。坐落在芷溪沿河路竹坑桥头东侧，为芷溪杨氏开基祖第十七世裔孙渔溪公开创兴建，后由其子翥云、润田、腾风续建，历时10余年。
集鳣堂采用客家普遍的“九厅十八井”的建筑形式，建有二进门楼、雨坪、月池、2口水井、内外文武学堂、后花园和大小房屋101间，建筑面积5356平方米，总占地面积10000多平方米。集鳣堂的建筑设计是典型的框架结构，9个厅堂两厢壁板及门扇拆下，恰可铺设18个天井位置，摆120张八仙桌宴请宾客，晒99担谷子，都显得绰绰有余，其建筑之宏大，布局之科学，计算之准确，令人自叹弗如。
集鳣堂外门楼题字“南离辉映”为清代著名书法家何绍基墨宝，每字缺少一笔，缘为该民居坐向与紫禁城一致，应避讳和堪舆先生所谓的“制化”。厅内“渔溪”牌匾为清代福建才子邱振芳所书，另有孟超然、伊秉绶、廖怀清等名贤墨宝，爱国名臣林则徐亦题诗云，“朝霞照水红初艳，新柳笼烟绿已齐。缥缈香飞仙掌外，从容人到凤池西。”
鸿兰堂，位于上松树坝，门楼精美，门楹题刻“南离焕彩”。
衍禧堂，位于上松树坝，黄永源故居，俗称“老救世堂”，曾是连城县最早的基督教教堂，1929年曾作为红军枪弹厂。门楼、屏墙精美，门柱石狮雕工精细，花窗秀美，屋内梁上倒吊木雕花篮精雕细刻，工艺精湛。黄永源和同乡黄鸣谦、黄翼深与周恩来、邓小平、聂荣臻、李富春等人留学法国，留学期间失足坠落塞纳河，英年早逝。
景福堂，位于翠畴公祠东侧，门楼保存完整，飞檐翘角，砖雕精美，颇有小家碧玉之美。
峻亭公祠，又称永思堂，位于凉棚街，为芷溪杨氏开基祖第十九世裔孙峻亭公建于嘉庆二十二年（1817年），建筑面积约1000多平方米。
杨峻亭，名钦，字明安。侨居福州30多年，接管父亲的和昌木行，成就了芷溪第二代“百万公”。杨峻亭一生乐善好施，在福州曾带头倡建浦西路口大桥，并且疏通西河一带河沟。而芷溪的峻亭公祠也因为先后被辟为芷溪工农小学、芷溪小学、连城二中、芷溪中心幼儿园等学校而被誉为“连南文化的摇篮”。
集庆堂，位于大圳路，又称“进士大门”，为杨氏十六世祖杨挺山建于清康熙年间，砖木结构，四进四直横屋，门内雨坪为鹅卵石图案，厅内五柱到顶，为武进士杨彪故居，其胞弟仰亭为同科同榜文举人，称“兄弟登科”。
丽章公祠，位于大圳路旁，为杨氏十五世祖杨高爆祠，公有子五孙廿五曾孙百廿八人，今芷溪杨氏多为其子孙，公祠门楼题刻“庆衍东京”。
余庆堂，当地一般称三大门闾，位于西街路，清康熙年间始建，“历经数十年，后人增拓之”，占地10000多平方米。其总祠和5座子祠按“火”字型布局，兼有会客厅、宾舍、学堂、议事厅、演武场、巷道、宅院等，从而形成祠宅合一、祠中有祠、院中有院的格局。
余庆堂素有芷溪的书香门第之美誉，清朝时期有邑庠46人、郡庠5人、廪生14人、监生6人、贡生16人、国学生4人和举人6人，杨福、杨廉、杨登璐等人曾任知县闻名于外，余庆堂一脉更是接连七代出了秀才，现保存芷溪仅存的杨鹏、杨福叔侄的“文武魁”牌匾。
华岳公祠，坐落于芷溪中心点，俗称“花中心”。建于明代，建筑面积约300平方米，为二进厅中轴对称结构，门楼是半石牌楼式，为紫色砂砾岩和花岗岩所造。
三斯堂，位于土楼下，雕栏屏风，花窗假山，是书香门第，黄雪丰、黄肇河叔侄二人为清末举人。黄肇河，曾任民国初年众议院议员、国立中山大学国文教师，是远近闻名的书法家，芷溪及周边乡隘多存有其墨宝，现三斯堂内存有他中举时的“朱笔木雕版”6块，全文完整。
八大家人，位于土楼下，建于明代，拱门庭院仿江南园林，厅内雕梁精美，木窗独具一格，神龛为半圆月嵌入式，实为少见。
万斯堂、永裕堂，位于黄沙坝，为杨氏第二代“百万公”西林公建，两堂相依，座向一致，格局相同，永裕堂晚建于万斯堂，多一直横屋和一个后花园，两堂有芷溪的“荣国府、宁国府”之称。两堂保存较为完整，属九厅十八井，院落舒畅，集厅堂、厢房、过道、回廊、走廊、天井、雨坪、花园和内外学堂于一体，花窗雕刻精美，存有何绍基“鳣堂爱日”匾。
怡庆堂，位于黄沙坝，为杨氏第二代“百万公”峻亭公长孙杨景仁建，九厅十八井加一直横屋，是芷溪古民居中最大的深宅大院之一，建有二进门楼、雨坪、月池、2口水井、内外文武学堂和大花园，占地10000多平方米，门楼坐北朝南，门楹题刻“瑞曜光腾”。
积庆堂，位于黄沙坝，门楼坐西朝东，引入鹅卵石小巷，庭院错落有致，雕梁和花窗、屏风木雕精美。
敦安堂，位于下松树坝，原为杨氏大宅，后转卖予黄姓，门楼门楹题刻“南极辉临”，门内即见学堂，转拱门屏风入厅堂，中厅两侧为“福禄寿喜”砖雕花窗，上厅两侧大幅壁画精美。
肇衍公祠，位于松树坝，门楼高耸，斗拱分三层，层叠而上，门脊上塑双鸱吻，门楹上方汉白玉题刻“钦赐翰林院检讨”。
绍德堂，位于黄沙坝，有三厅两直横屋，门楼坐北朝南，门楹题刻“南极辉映”， 木雕花窗精美，外墙扇窗具有特色。
耀南公祠，位于水尾，又名惇叙堂，建于清朝乾隆至嘉庆年间，祀黄氏三房八世祖耀南公，木牌楼宏伟庄严，为芷溪古存的三座木牌楼之一，内有“华配”。
永建堂，位于黄沙坝，清代黄森云所建，为九厅十八井，砖木结构，大门内雨坪宽敞，中间用一大扇拱门带飞檐屏风间隔，风格别具。
务滋堂，位于芜山下，清代黄善堂兴建，三厅四直横屋，门楼题刻“瑞气长凝”，入门为一狭长雨坪，厅内雕梁精细，存有“大夫第”木匾两块，该堂裔孙黄碧珊为清代五品广东博罗县县令。
怀清堂，位于黄沙坝，门楼精美，门楹题刻“青莲行瑞”。
春熙堂，位于芜山下，为清代杨笏山建，为九厅十八井，建筑面积庞大，但毁坏较为眼中，残留山墙风格独特。
杨簧故居，位于草坪，为杨簧故居。杨簧，字竹圃，嘉庆庚辰年（1820年）中进士，签分刑部浙江司主事，后升授陕西司郎中，接着改任军机司员上行走，列为京察一等。道光乙酉年（1825年）出任陕西延榆绥兵备道，连任江苏苏松、常太分巡粮道，庚寅年（1830年）升任湖南按察使，癸巳年（1833年）升任江宁布政使，甲午年（1834年）调署江苏巡抚，丙申年（1836年）调任护理两江总督。
立纲堂，位于水井背，建于清朝乾隆年间，为九厅十八井，占地面积6666.6平方米，布局宏大，厅堂、厢房、回廊、天井、雨坪、和学堂形成一个完全封闭的整体，门楼题刻“耀接扶桑”。
